真菌广泛分布于全世界的各种栖地中，包括气候极端的环境如沙漠、深海、高寒、高温以及受辐射污染的地区，有些种类对辐射的抗性极强，某些地衣可以抵挡高强度的宇宙射线与紫外线，在人造卫星上的研究站存活。